Na het droogvallen op 1 juli 1852 duurde het nog tot 11 juli 1855 voordat de Haarlemmermeer een gemeente werd. De eerste burgemeester was Matthijs Samuel Petrus Pabst, de huidige burgemeester is Onno Hoes. Het gemeentehuis stond oorspronkelijk in Heemstede, maar staat sinds 1867 in Hoofddorp.
Op 1 januari 2019 fuseerden de gemeenten Haarlemmerliede en Spaarnwoude en Haarlemmermeer waardoor de gemeente nu ook buiten de Haarlemmermeerpolder ligt.